首个万份水稻群体变异图谱发布

　　10月16日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内多家高校和科研单位发布了首个万份水稻群体变异图谱，为进一步探究水稻群体遗传和功能基因组研究提供了重要参考。相关研究成果发表在《核酸研究（Nucleic Acids Research）》上。

 

　　水稻是世界上最重要的粮食作物之一，其自然变异是基因改良和现代育种的重要遗传基础，从更大规模的水稻群体中鉴定基因组自然变异，挖掘稀有变异及其潜在应用对水稻育种具有重要意义。

 

　　科研人员结合水稻超级泛基因组对一万多份水稻进行了群体水平最大的自然变异分型，构建了水稻超大规模的群体基因组变异数据集，并在此基础上，将一万份群体重新划分了亚群，纠正了部分水稻籼粳分类上的错误；利用万份水稻群体变异，广泛分析了重要功能基因在不同亚群中的群体频率和丰富的等位基因型，鉴定了其中的优异自然变异；建立了面向全球用户的在线数据库平台，提供单倍型整合分析、变异图谱分析和系统发育树分析等多个常用功能。该研究为开展水稻的自然变异研究提供了重要方法参考和有力工具。

 

　　该研究得到国家自然科学基金基础科学中心、广东省自然科学基金杰出青年基金、中国农科院青年创新专项资金的支持。（通讯员 马昕怡）

 

　　原文链接：https://doi.org/10.1093/nar/gkad840